Skeda:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Nuk ka përmasa më të madhaja.

Phylogenetic_tree_of_coronaviruses.jpg ‎((përmasa 571 × 451 px, madhësia skedës: 75 KB, lloji MIME: image/jpeg))

Kjo skedë është prej Wikimedia Commons dhe mund të përdoret nga projekte të tjera. Përshkrimi në këtë skedë në këtë faqe nuk është treguar më poshtë.

Shko tek faqja përshkruese në Commons

Përmbledhje

PërshkrimiPhylogenetic tree of coronaviruses.jpg	English: Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. Bootstrap values were calculated from 1000 trees. 1118 amino acid positions in Pol were included. The scale bar indicates the estimated number of substitutions per 20 amino acids. All abbreviations for the coronaviruses were the same as those in Figure 1.
Data	24 gusht 2010
Burimi	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/
Autori	Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen

Licencim

Kjo skedë është dhënë për përdorim sipas licensës Creative Commons Attribution 3.0 Unported.

Je i lirë të:

ta shpërndani – ta kopjoni, rishpërndani dhe përcillni punën
t’i bëni “remix” – të përshtatni punën

Sipas kushteve të mëposhtme:

atribuim – Duhet t’i jepni meritat e duhura, të siguroni një lidhje për tek licenca dhe të tregoni nëse janë bërë ndryshime. Këtë mund ta bëni në ndonjë mënyrë të arsyeshme, por jo në ndonjë mënyrë që sugjeron se licencuesi ju del zot juve apo përdorimit tuaj.

Historiku skedës

Shtypni mbi një datë/kohë për ta parë skedën siç ishte atëherë.

	Data/Koha	Miniaturë	Përmasat	Përdoruesi	Koment
e tanishme	7 mars 2020 04:42		571 × 451 (75 KB)	Guest2625	Uploaded a work by Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/ with UploadWizard

Lidhje skedash

Këto faqe lidhen tek kjo skedë:

Koronavirusi

Përdorimi global i skedës

Kjo skedë përdoret nga Wiki të tjera në vijim:

Përdorimi në bn.wikipedia.org
- করোনাভাইরাস
Përdorimi në en.wikipedia.org
- Coronavirus
Përdorimi në fa.wikipedia.org
- کروناویروس
Përdorimi në fr.wikipedia.org
- Coronavirus
Përdorimi në ig.wikipedia.org
- Nje Korona
Përdorimi në su.wikipedia.org
- Koronavirus

Metadata

Kjo skedë përmban hollësira të tjera të cilat mund të jenë shtuar nga kamera ose skaneri dixhital që është përdorur për ta krijuar.

Në qoftë se skeda është ndryshuar nga gjendja origjinale, disa hollësira mund të mos pasqyrojnë versionin e tanishëm.

Titulli i figurës	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Autor	Patrick C. Y. Woo
Titull i shkurtër	Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis
Komenti i JPEG dokumentit	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Fjalët kyçe	coronavirus genome bioinformatics

Skeda:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Përmbledhje

Licencim

Captions

Items portrayed in this file

përshkruan

phylogenetic tree ^anglisht

statusi i të drejtës së autorit

me të drejta autori

liçensa

CC BY 3.0

fillimi

24 gusht 2010

lloji i medies

image/jpeg

Historiku skedës

Lidhje skedash

Përdorimi global i skedës

Metadata

Skeda:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Përmbledhje

Licencim

Captions

Items portrayed in this file

përshkruan

phylogenetic tree anglisht

statusi i të drejtës së autorit

me të drejta autori

liçensa

CC BY 3.0

fillimi

24 gusht 2010

lloji i medies

image/jpeg

Historiku skedës

Lidhje skedash

Përdorimi global i skedës

Metadata

phylogenetic tree ^anglisht