Wayne Rooney: Dallime mes rishikimesh

Rooney u dërgua jashtë në një ndeshje Tournament Amsterdamit kundër Portos, më 4 gusht 2006 pas goditur mbrojtësin Pepe Porto me një bërryl. [77] Ai u dënua me një ndalim tre-ndeshjes nga FA, pas marrjes së tyre në një raport 23 faqesh nga arbitër Ruud Bossen që shpjegoi vendimin e tij. [78] Rooney shkroi një letër proteste të FA, duke përmendur mungesën e dënimit dorëzuar për shkak të lojtarëve të tjerë të cilët u dërguan jashtë në miqësore. Ai gjithashtu ka kërcënuar për të tërhequr lejen e FA-së për të përdorur të drejtat e tij imazhin e në qoftë se ata nuk kanë heqë ndalesën, por FA nuk kishte fuqi për të bërë një vendim të tillë. [79]

Gjatë gjysmës së parë të sezonit 2006-07, Rooney përfundoi një dhjetë-lojë pa gola brez me një hat-trick kundër Bolton Wanderers, [80] dhe ai ka nënshkruar një zgjatje dyvjeçare të kontratës muajin e ardhshëm që lidhi të Bashkuara deri në vitin 2012 . Deri në fund të prillit, një kombinim i dy gola në një fitore 8-3 agregat çerek-final mbi romët dhe dy më shumë në një fitore gjysmë-finale këmbë 3-2 parë mbi Milanin. [81] Deri në fund të këtij sezoni, ai kishte shënuar 14 gola ligës. [82] Rooney mbledhur medaljen e tij të parë Premier League Winner titulli në fund të sezonit 2006-07. [83]