Në filmin artistik ai ka shkruar katër skenarë, përmendim këtu skenarin e filmit "[[Thirrja]]" që do të ishte dhe skenari i tij i parë në filmin artistik në vitin 1976,
filmat “Ata“[[Ata ishin katër”katër]]” dhe “Cirku“[[Cirku në fshat”fshat]]” në vitin 1977, filmin “Këshilltarët”“[[Këshilltarët]]” në vitin 1979. Pas viteve 90’ Kujtim Gjonaj ka qenë për një kohë Drejtor i Alba Filmit dhe më pas krijoi një shtëpi prodhuese filmike, "Bota Shqiptare", ndërmjet të cilës vazhdon krijimtarinë e tij profesionale. Kjo shtëpi prodhuese është edhe një shtëpi botimi ma anë të së cilës botuesi Gjonaj prodhon biografitë e figurave të shquara të kombit si [[Ali_Pashë_Tepelena|Ali Pasha Tepelenën]], [[Faik Konica]], [[Jeronim De Rada]], [[Naim Frashëri]], [[Nënë Tereza]], [[Sulejman Pitarka]] (Artist i Popullit)), etj. Këto biografi i shërbejnë më pas si bazë për skenarët e filmave dokumentarë mbi këto figura. Me dokumentarin "Enciklopedi që ecën më këmbë", Kujtim Gjonaj do të vlerësohej me Kupën e Festivalit në Festivalin e XII-të të Filmit Dokumentar Shqiptar të mbajtur në Tiranë në vitin 2006.
