Morina e nisi sezonin e tij të tretë me ''Bardheblutë'' duke fituar [[2012 Superkupa e Shqipërisë|Superkupën e Shqipërisë]] më 19 gusht 2012 pas fitores 1–2 kundër [[KF Skënderbeu|Skënderbeut]].<ref>{{cite news|url=http://www.partizani.net/files/news.php?readmore=8053 |title=Tirana fiton Superkupën e Shqipërisë |language=Shqip |work=Futbolli Shqiptar |accessdate=6 prill 2014 |date=19 gusht 2012}}</ref> Ai shënoi golat e parë sezonal më 2 shtator në fitoren 3–0 kundër [[KS Shkumbini|Shkumbinit]].<ref>{{cite news|first=Altin |last=Manallari |url=http://gazeta-shqip.com/lajme/2012/09/03/fiton-tirana-luftetari-ben-shou/ |title=Bardhebutë mundin 3-0 Shkumbinin, gjirokastritët shkatërrojnë 4-1 Teutën |language=Shqip |work=Gazeta Shqip |accessdate=7 prill 2014 |date=2 shtator 2012}}</ref><ref>{{cite news|url=http://int.soccerway.com/matches/2012/09/02/albania/super-league/kf-tirana/ks-shkumbini-peqin/1305970/ |title=Tirana vs Shkumbini Peqin |language=Anglisht |work=Soccerway.com |accessdate=7 prill 2014 |date=2 shtator 2012}}</ref> Njëzetekatër ditë më vonë, në [[Derbi I|derbin e madhëmadh]] kundër [[FK Partizani|Partizanit]] për ndeshjen e kthimit në raundin e parë të [[Kupa e Shqipërisë 2012-13|kupës]], Morina shënoi golin e avantazhit pas vetëm tetë minutash dhe ndihmoi skuadrën të fitonte ndeshjen me rezultatin 2–1 dhe të kalonte në fazën tjetër. Më 7 nëntor, në ndeshjen e kthimit të raundin e dytë, Morina shënoi golin e dytë të skuadrës duke ndihmuar në përmbysjen e rezultatit nga 0–2 në 3–2, megjithatë, Tirana u eleminua nga kupa me rezultatin e përgjithshëm 6–3 pasi kishte humbur ndeshjen e parë 4–0.<ref>{{cite news|url=http://www.partizani.net/files/news.php?readmore=8431 |title=Tirana disfate ne Kukes, Flamurtari fiton |language=Shqip |work=Futbolli Shqiptar|accessdate=8 prill 2014 |date=7 nëntor 2012}}</ref>.
Morina vazhdoi formën e tij të mirë më 2 Marsmars duke shënuar një dygolësh dhe duke i dhuruar fitoren 2–1 kundër [[KS Luftëtari|Luftëtarit]] duke e vendosur Tiranën në vendin e katërt të ligës pas 17 ndeshjesh, vetëm 2dy pikë larg [[KS Flamurtari Vlorë|Flamurtarit]] dhe 4 pikë larg [[KS Teuta|Teutës]], 2dy vendet që të kualifikonin për në raundin e parë të [[UEFA Liga e EiropësEvropës|Ligës së EiropësEvropës]].<ref>{{cite news|url=https://www.youtube.com/watch?v=Q0bKfmpx0vo |title=Java 17: Tirana - Luftetari 2-1 |language=Shqip |work=You Tube|accessdate=8 prill 2014 |date=2 Marsmars 2013}}</ref> Morina shënoi sërisht dy javë më vonë më 16 Marsmars në humbjen shkatërrimtare 3–6 kundër Flamurtarit.<ref>{{cite news|first=Altin |last=Manallari |url=http://gazeta-shqip.com/lajme/2013/03/17/tirana-shkermoqet-5-gola-ne-45-minuta/ |title=Tirana shkërmoqet, 5 gola në 45 minuta |language=Shqip |work=Gazeta Shqip|accessdate=8 prill 2014 |date=16 Marsmars 2013}}</ref>
Morina e mbylli sezonin me 33 ndeshje në të gjitha kompedicionet, ku 26 i luajti në ligë, 4 në kupë dhe 3 në Ligën e EuropësEvropës, dhe me 8 gola, ku 6 u shënuan në ligë dhe 2 në kupë. Tirana e mbylli sezonin në vendin e pestë duke dështuar për t'u kualifikuar në kupa europiane për herë të parë që nga sezonin 2002–03.
