[Redaktim i kontrolluar][Redaktim i kontrolluar]
Content deleted Content added
Lidhje të jashtme të shpëtuara: 5 Lidhje të jashtme të etiketuara si të vdekura: 0) #IABot (v2.0
Lidhje të jashtme të shpëtuara: 7 Lidhje të jashtme të etiketuara si të vdekura: 0) #IABot (v2.0
Rreshti 10:
Vlerësimet për numrin e [[Specia|specieve]] aktuale të Tokës variojnë nga 2 milion në 1 trilion,<ref name="Larsen2017">{{Cite journal|last=Brendan B. Larsen|last2=Elizabeth C. Miller|last3=Matthew K. Rhodes|last4=John J. Wiens|date=September 2017|title=Inordinate Fondness Multiplied and Distributed:The Number of Species on Earth and the New Pie of Life|url=http://www.wienslab.com/Publications_files/Larsen_et_al_QRB_2017.pdf|journal=The Quarterly Review of Biology|volume=92|issue=3|page=230|access-date=11 November 2019}}</ref> prej të cilave mbi 1.7 milion janë dokumentuar.<ref>{{Cite journal|last=Anderson|first=Alyssa M.|year=2018|title=Describing the Undiscovered|url=https://scholar.google.com/scholar?hl=en&as_sdt=0%2C24&as_ylo=2018&as_yhi=2018&q=Anderson+%22Describing+the+undiscovered%22&btnG=|journal=Chironomus: Journal of Chironomidae Research|issue=31|pages=2–3|doi=10.5324/cjcr.v0i31.2887}}</ref> Më shumë se 99% e të gjitha specieve, që arrijnë në mbi pesë miliardë specie,<ref name="Book-Biology">{{Cite book|editor-last=Kunin, W.E.|title=The Biology of Rarity: Causes and consequences of rare – common differences|url=https://books.google.com/books?id=4LHnCAAAQBAJ&pg=PA110&lpg=PA110&dq#v=onepage&q&f=false|year=1996|isbn=978-0-412-63380-5|accessdate=26 May 2015}}</ref> që kanë jetuar ndonjëherë vlerësohet të jenë në zhdukje.<ref name="StearnsStearns2000">{{Cite book|last=Stearns|first=Beverly Peterson|last2=Stearns|first2=S.C.|last3=Stearns|first3=Stephen C.|title=Watching, from the Edge of Extinction|url=https://books.google.com/books?id=0BHeC-tXIB4C&q=99%20percent#v=onepage&q=99%20percent&f=false|year=2000|publisher=Yale University Press|isbn=978-0-300-08469-6|page=preface x|accessdate=30 May 2017}}</ref> <ref name="NYT-20141108-MJN">{{Cite news|url=https://www.nytimes.com/2014/11/09/opinion/sunday/prehistorys-brilliant-future.html|title=Prehistory's Brilliant Future|last=Novacek|first=Michael J.|date=8 November 2014|work=[[New York Times]]|access-date=25 December 2014}}</ref>
 
Në vitin 2016, u identifikua një grup prej 355 [[Gjeni|gjenesh]] nga paraardhësi i fundit universal i përbashkët (LUCA) i të gjithë organizmave.<ref name="Weissetal">{{Cite journal|last=Weiss|first=Madeline C.|last2=Sousa|first2=Filipa L.|last3=Mrnjavac|first3=Natalia|last4=Neukirchen|first4=Sinje|last5=Roettger|first5=Mayo|last6=Nelson-Sathi|first6=Shijulal|last7=Martin|first7=William F.|date=2016|title=The physiology and habitat of the last universal common ancestor|url=https://zenodo.org/record/3451085|journal=Nature Microbiology|volume=1|issue=9|pages=16116|doi=10.1038/nmicrobiol.2016.116|pmid=27562259|access-date=2 prill 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20191018153355/https://zenodo.org/record/3451085|archive-date=18 tetor 2019|url-status=dead}}</ref> <ref name="NYT-20160725">{{Cite news|url=https://www.nytimes.com/2016/07/26/science/last-universal-ancestor.html|title=Meet Luca, the Ancestor of All Living Things|last=Wade|first=Nicholas|date=25 July 2016|work=New York Times|access-date=25 July 2016|author-link=Nicholas Wade}}</ref>
 
== Etimologjia ==
Rreshti 164:
Lokacioni më së shpeshti i pranuar nga rrënjët e [[ Pema e jetës (biologjia)|pemës së jetës]] është në mes të një monophyletic domain [[Bacteria|Bakteret]] dhe një clade formuar nga [[Archaea]] dhe [[Eukarioti|Eukaryota]] të asaj që është referuar si "pema tradicionale e jetës", në bazë të disa studimeve molekulare.<ref>{{cite journal | last1 = Brown | first1 = J.R. | last2 = Doolittle | first2 = W.F. | year = 1995 | title = Root of the Universal Tree of Life Based on Ancient Aminoacyl-tRNA Synthetase Gene Duplications | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | volume = 92 | issue = 7| pages = 2441–2445 | pmid = 7708661 | pmc=42233 | doi=10.1073/pnas.92.7.2441}}</ref><ref>{{cite journal | last1 = Gogarten | first1 = J.P. | last2 = Kibak | first2 = H. | last3 = Dittrich | first3 = P. | last4 = Taiz | first4 = L. | last5 = Bowman | first5 = E.J. | last6 = Bowman | first6 = B.J. | last7 = Manolson | first7 = M.F. |display-authors=etal | year = 1989 | title = Evolution of the Vacuolar H+-ATPase: Implications for the Origin of Eukaryotes | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | volume = 86 | issue = 17| pages = 6661–6665 | pmid = 2528146 | pmc=297905 | doi=10.1073/pnas.86.17.6661}}</ref><ref>{{cite journal | last1 = Gogarten | first1 = J.P. | last2 = Taiz | first2 = L. | year = 1992 | title = Evolution of Proton Pumping ATPases: Rooting the Tree of Life | journal = Photosynthesis Research | volume = 33 | issue = 2| pages = 137–146 | doi = 10.1007/BF00039176| pmid = 24408574 }}</ref><ref>{{cite journal | last1 = Gribaldo | first1 = S | last2 = Cammarano | first2 = P | year = 1998 | title = The Root of the Universal Tree of Life Inferred from Anciently Duplicated Genes Encoding Components of the Protein-Targeting Machinery | url = | journal = Journal of Molecular Evolution | volume = 47 | issue = 5| pages = 508–516 | pmid = 9797401 | doi=10.1007/pl00006407}}</ref><ref>{{cite journal | last1 = Iwabe | first1 = Naoyuki | last2 = Kuma | first2 = Kei-Ichi | last3 = Hasegawa | first3 = Masami | last4 = Osawa | first4 = Syozo | last5 = Miyata Source | first5 = Takashi | last6 = Hasegawa | first6 = Masami | last7 = Osawa | first7 = Syozo | last8 = Miyata | first8 = Takashi | year = 1989 | title = Evolutionary Relationship of Archaebacteria, Eubacteria, and Eukaryotes Inferred from Phylogenetic Trees of Duplicated Genes | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | volume = 86 | issue = 23| pages = 9355–9359 | pmid = 2531898 | pmc=298494 | doi=10.1073/pnas.86.23.9355}}</ref><ref>{{cite book |editor1-first=David R. |editor1-last=Boone |editor2-first=Richard W. |editor2-last=Castenholz |editor3-first=George M. |editor3-last=Garrity |title=The ''Archaea'' and the Deeply Branching and Phototrophic ''Bacteria'' |series=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |isbn=978-0-387-21609-6 |url=https://www.springer.com/life+sciences/microbiology/book/978-0-387-98771-2 |doi=10.1007/978-0-387-21609-6|publisher=Springer |year=2001}}{{page needed|date=June 2014}}</ref> Një pakicë shumë e vogël studimesh kanë përfunduar ndryshe, domethënë që rrënja është në fushën e Baktereve, qoftë në Firmicutes të azilit <ref>{{cite journal |author=Valas, R.E. |author2=Bourne, P.E. |title=The origin of a derived superkingdom: how a gram-positive bacterium crossed the desert to become an archaeon |journal=Biology Direct |volume=6 |issue= |page=16 |year=2011 |pmid=21356104 |pmc=3056875 |doi=10.1186/1745-6150-6-16}}</ref> ose që [[Chloroflexi|Chloroflexi i azilit]] është bazik në një kladë me Archaea dhe Eukaryotes dhe pjesën tjetër të Baktereve siç propozohet nga [[Thomas Cavalier-Smith]] . <ref name=CS2>{{cite journal |author=Cavalier-Smith T |title=Rooting the tree of life by transition analyses |journal=Biology Direct |volume=1 |page=19 |year=2006 |pmid=16834776 |pmc=1586193 |doi=10.1186/1745-6150-1-19}}</ref>
 
Hulumtimi i publikuar në vitin 2016, nga [[ William F. Martin|William F. Martin]], duke analizuar gjenetikisht 6.1 milion gjenet që kodojnë proteina nga gjenet prokariotike të sekuencave të pemëve të ndryshme filogjenetike, identifikuan 355 grupe proteinash nga mesi 286.514 grupimeve proteinike që ishin ndoshta të zakonshme për LUCA. Rezultatet "LUCA përshkruaj si [[ Organizmi anaerobe|anaerobe]], CO<sub>2</sub> -ndreqje, H<sub>2</sub> -e pavarur me një [[ Rruga dru – Ljungdahl|rrugë të drurit LJUNGDAHL]] (në reduktiv [[ Acetil-CoA|acetil-coenzyme A]] shteg), N<sub>2</sub> -ndreqje dhe thermophilic. Biokimi i LUCA ishte i mbushur me grupime FeS dhe mekanizma radikalë të reagimit. Kofaktorët e saj zbulojnë varësi nga [[ Metalet e tranzicionit|metalet]] në [[ Metalet e tranzicionit|tranzicion]], [[ Flavin mononukleotid|flavins]], [[ S-adenosil metionine|S-adenosyl metionine]], [[ Koenzima A|koenzima A]], [[ Ferredoxin|ferredoxin]], [[ Molybdopterin|molibbopterina]], [[ Corrin|corrins]] dhe [[seleni]] . Kodin e tij gjenetik kërkohet [[Nukleozidi|nukleozidë]] modifikime dhe S-adenosylmethionine-varur [[ methylation|methylations]] . " Rezultatet përshkruajnë clostria metanogjene si një kadës bazale në 355 linjat e ekzaminuara, dhe sugjerojnë që LUCA të banojë në një ambient të [[ Ventilë hidrotermale|rrjedhjes hidrotermale]] anaerobe në një mjedis gjeokimikisht aktiv të pasur me H<sub>2</sub>, CO<sub>2</sub> dhe hekur.<ref name="nature">{{cite journal | doi = 10.1038/NMICROBIOL.2016.116 | pmid = 27562259 | volume = 1 | issue = 9 | title = The physiology and habitat of the last universal common ancestor | year = 2016 | journal = Nat Microbiol | page = 16116 | last1 = Weiss | first1 = MC | last2 = Sousa | first2 = FL | last3 = Mrnjavac | first3 = N | last4 = Neukirchen | first4 = S | last5 = Roettger | first5 = M | last6 = Nelson-Sathi | first6 = S | last7 = Martin | first7 = WF | url = https://zenodo.org/record/3451085 | access-date = 2 prill 2020 | archive-url = https://web.archive.org/web/20191018153355/https://zenodo.org/record/3451085 | archive-date = 18 tetor 2019 | url-status = dead }}</ref> Sidoqoftë, identifikimi i këtyre gjeneve si të pranishëm në LUCA u kritikua, duke sugjeruar që shumë nga proteinat e supozuara të jenë të pranishme në LUCA përfaqësojnë transferime të mëvonshme të gjenit horizontale midis arkeës dhe baktereve. <ref>{{cite journal | last1 = Gogarten | first1 = JP | last2 = Deamer | first2 = D | date = Nov 2016 | title = Is LUCA a thermophilic progenitor? | url =https://zenodo.org/record/895471 | journal = Nat Microbiol | volume = 1 | issue = 12| page = 16229 | doi = 10.1038/nmicrobiol.2016.229| pmid = 27886195 }}</ref>
 
=== Riprodhim ===