Muzeu i kështjellës ndodhet në një nga mjediset e Kështjellës Rozafa. Në këtë muze janë të ekspozuara dëshmi të banimit të Shkodrës në periudha të ndryshme historike. Pjesë e tij janë armë e dokumenta të ndryshme, dëshmi e luftrave historike të Shkodrës ndaj pushtuesve të ndryshëm të shfaqur në kohë të ndryshme në Shkodër, dëshmi e veprimtarive të feudaleve Bushatllinj etj. në shek XVIII.